成為策展單位只是挑戰的開始，財經記者出身的袁乃娟，沒有科技背景，要整合以科技呈現藝術的展品，本身就是一件困難的事情，若要在國際性會場上呈現，更是一大挑戰。袁乃娟說：「這個案子最大的挑戰在於，工研院的技術有那麼多品項，到底哪些技術要被篩選出來？」袁乃娟耗費兩年半時間，不斷地跟工研院各所和各中心工程師們請益、討論、辯論，甚至爭執。
因為花博是台灣七十年來最大規模，也是唯一一次的國際博覽會，對所有人來說，這可能是唯一參與這種規模展覽的機會，因此每個人都想傾所有能量，實現自己的夢想。
但是袁乃娟很清楚：「一個集眾人之力而成就的跨領域作品，需要眾人攜手才能創造高峰。過程裡，個人創作有時必須被壓抑的。」因此，為了成就可以持續半年穩定營運的展館，袁乃娟必須不斷把所有人拉到同一條線上，讓不同專業領域的人攜手合作。
跨領域的合作雖然充滿困難挑戰，但也充滿想像的可能。
袁乃娟表示，舉例來說 ,工研院材化所有一個技術叫做電控液晶玻璃，這個技術是一個曲面的電控液晶玻璃，不是平板的電控液晶玻璃，通電的時候它是透明的，不通電的時候它是霧面的，透過伏特數的變化，可以產生不同的灰階的通透性變化。這個特性讓袁乃娟聯想到玫瑰花瓣。以這個發想為基礎與工程師在溝通中，產生更多對不同技術的想像。
她認為，當工程師的想像力，遇上藝術家的創造力，就能讓展品產生更多的可能。
夢想館的入口，有一朵名叫「綻放」的機械花朵，袁乃娟剛開始與藝術家游文富溝通時，就告訴對方，希望這個作品能讓所有拉開夢想館布幕的觀眾嚇一跳，游文富根據這樣的描述盡情想像，最後創造出令人驚艷的展品──「綻放」。
對參與此次夢想館專案的工程師而言，參與這個案子最大的突破，就是對事情的看法，有了不同的思維。他們發現科技的想像，可以很高遠，也讓大家對科技的展示方法，有了新的認識。
袁乃娟記得某次在夢想館大廳，導覽人員告訴進來的三十二位觀眾說，懸吊在六個角落的紙喇叭是由工研院研發出來的，有一位七十多歲的婆婆，當場讚嘆地說：「我們台灣好厲害！」這句話讓袁乃娟當場留下眼淚。
過去工研院一直努力讓國人了解到台灣科技的能量，但推廣方式幾乎都是靜態展示，設立攤位解釋技術的原理，希望取得民眾的認知與了解，但是透過夢想館，讓大家對於科技展示手法有新的了解──科技必須透過情境，才能與社會大眾溝通；必須與生活連結才能展現出不同於知識的想像。
夢想館的成形，是把科技人對於未來的生活夢想，真實的展現在民眾面前。工研院成功讓生活在台灣土地上的民眾，認同台灣科技的力量。